Di planet yang dikenali sebagai Bumi Ketiga, Kucing-kucing telah hidup dan berkembang selama beberapa generasi di kerajaan Thundera. Kucing-kucing dipimpin oleh Claudus, bersama anaknya dan pewaris Lion-O. Satu malam kerajaan diserang oleh tentera Biawak yang diketuai oleh ahli sihir jahat Mumm-Ra. Dengan mereka, Biawak membawa teknologi (konsep yang tidak dikenali oleh Kucing). Kerana ini, Thundera hancur, Claudus dibunuh oleh Mumm-Ra, dan Kucing-kucing yang lain diperbudak. Sekumpulan Thunderians yang masih hidup dipimpin oleh Lion-O (yang memegang Pedang Omens yang kuat) melarikan diri dari kota yang musnah untuk mencari Buku Omens yang dikatakan memiliki pengetahuan yang diperlukan untuk mengalahkan Mumm-Ra. Setelah mereka menemuinya, ThunderCats menyedari bahawa agar mereka dapat mengalahkan Mumm-Ra, mereka mesti menyatukan semua spesies yang berlainan yang hidup di Bumi Ketiga. ThunderCats juga mendapati bahawa mereka harus mencari tiga batu kekuatan yang kalau dijumpai oleh Mumm-Ra akan memberinya kekuatan untuk menjadi makhluk terkuat di alam semesta.